Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNA2P16389 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNA2P16389 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNA2P16389 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms