Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGB4P16144 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms