Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA1P15976 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA1P15976 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GATA1P15976 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATA1P15976 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATA1P15976 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATA1P15976 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms