Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF3P15923 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF3P15923 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF3P15923 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF3P15923 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF3P15923 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF3P15923 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF3P15923 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF3P15923 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF3P15923 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF3P15923 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF3P15923 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF3P15923 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms