Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCLS1P14317 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCLS1P14317 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HCLS1P14317 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HCLS1P14317 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCLS1P14317 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms