Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BMP4P12644 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BMP4P12644 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BMP4P12644 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BMP4P12644 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BMP4P12644 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BMP4P12644 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BMP4P12644 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP4P12644 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP4P12644 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP4P12644 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP4P12644 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms