Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFHP12036 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFHP12036 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFHP12036 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFHP12036 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFHP12036 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEFHP12036 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFHP12036 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFHP12036 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEFHP12036 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEFHP12036 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms