Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRFP10586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms