Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL3P10147 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3P10147 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3P10147 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3P10147 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3P10147 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL3P10147 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3P10147 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3P10147 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3P10147 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3P10147 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3P10147 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3P10147 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3P10147 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3P10147 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms