Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GLI2P10070 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI2P10070 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI2P10070 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI2P10070 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI2P10070 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GLI2P10070 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GLI2P10070 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GLI2P10070 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GLI2P10070 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GLI2P10070 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
GLI2P10070 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
GLI2P10070 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GLI2P10070 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GLI2P10070 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GLI2P10070 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI2P10070 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI2P10070 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI2P10070 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GLI2P10070 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GLI2P10070 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GLI2P10070 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GLI2P10070 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms