Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATXN8OSP0DMR3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATXN8OSP0DMR3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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