Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM17P0DL12 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms