Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2CP0DJJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2CP0DJJ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms