Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA1P0DJI8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms