Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RD3LP0DJH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RD3LP0DJH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms