Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1P0CG37 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFC1P0CG37 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms