Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFC1BP0CG36 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFC1BP0CG36 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms