Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF853P0CG23 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF853P0CG23 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF853P0CG23 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms