Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLRC4P0CG21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms