Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00032P0C843 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00032P0C843 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms