Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUPT20HL2P0C7V6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUPT20HL2P0C7V6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUPT20HL2P0C7V6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms