Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFTA3P0C7M3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms