Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC175P0C221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms