Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIL1P09327 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIL1P09327 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIL1P09327 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIL1P09327 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIL1P09327 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VIL1P09327 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VIL1P09327 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VIL1P09327 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIL1P09327 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VIL1P09327 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIL1P09327 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VIL1P09327 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VIL1P09327 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VIL1P09327 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VIL1P09327 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VIL1P09327 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VIL1P09327 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VIL1P09327 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VIL1P09327 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms