Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB1P08183 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB1P08183 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms