Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8AP07357 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8AP07357 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8AP07357 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8AP07357 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8AP07357 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8AP07357 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8AP07357 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8AP07357 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8AP07357 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8AP07357 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8AP07357 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8AP07357 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8AP07357 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C8AP07357 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms