Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCGP05129 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms