Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EGFRP00533 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EGFRP00533 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EGFRP00533 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EGFRP00533 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EGFRP00533 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EGFRP00533 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EGFRP00533 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EGFRP00533 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EGFRP00533 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EGFRP00533 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EGFRP00533 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EGFRP00533 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EGFRP00533 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EGFRP00533 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EGFRP00533 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EGFRP00533 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EGFRP00533 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EGFRP00533 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms