Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBX18O95935 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBX18O95935 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TBX18O95935 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TBX18O95935 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX18O95935 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX18O95935 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX18O95935 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX18O95935 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX18O95935 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX18O95935 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBX18O95935 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBX18O95935 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TBX18O95935 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TBX18O95935 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX18O95935 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX18O95935 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX18O95935 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBX18O95935 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBX18O95935 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBX18O95935 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.5 ms