Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4FO95754 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms