Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNAP29O95721 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAP29O95721 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms