Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL3O95573 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms