Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR4O95473 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR4O95473 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms