Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TJP3O95049 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TJP3O95049 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TJP3O95049 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TJP3O95049 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TJP3O95049 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TJP3O95049 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TJP3O95049 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TJP3O95049 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TJP3O95049 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TJP3O95049 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TJP3O95049 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TJP3O95049 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TJP3O95049 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TJP3O95049 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TJP3O95049 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms