Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH16O75309 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH16O75309 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH16O75309 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH16O75309 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH16O75309 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH16O75309 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH16O75309 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH16O75309 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH16O75309 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH16O75309 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH16O75309 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms