Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GADD45BO75293 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GADD45BO75293 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GADD45BO75293 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms