Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP9AO75110 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP9AO75110 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms