Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM3APO60318 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM3APO60318 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM3APO60318 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms