Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMARCA5O60264 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms