Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX6O43752 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX6O43752 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX6O43752 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX6O43752 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX6O43752 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX6O43752 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX6O43752 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX6O43752 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX6O43752 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX6O43752 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX6O43752 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX6O43752 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX6O43752 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX6O43752 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX6O43752 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX6O43752 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX6O43752 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
STX6O43752 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STX6O43752 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STX6O43752 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STX6O43752 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX6O43752 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX6O43752 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX6O43752 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX6O43752 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX6O43752 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX6O43752 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms