Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHP2O43745 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHP2O43745 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHP2O43745 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHP2O43745 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHP2O43745 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHP2O43745 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHP2O43745 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHP2O43745 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHP2O43745 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHP2O43745 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHP2O43745 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHP2O43745 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHP2O43745 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms