Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD51CO43502 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms