Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROM1O43490 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROM1O43490 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROM1O43490 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROM1O43490 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PROM1O43490 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROM1O43490 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROM1O43490 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROM1O43490 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROM1O43490 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROM1O43490 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROM1O43490 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROM1O43490 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROM1O43490 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms