Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRID2O43424 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRID2O43424 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRID2O43424 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRID2O43424 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRID2O43424 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRID2O43424 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRID2O43424 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRID2O43424 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRID2O43424 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms