Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTSS1O43312 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTSS1O43312 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms