Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEPT4O43236 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEPT4O43236 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEPT4O43236 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms