Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRXO43186 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRXO43186 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CRXO43186 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRXO43186 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRXO43186 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRXO43186 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRXO43186 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRXO43186 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRXO43186 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRXO43186 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRXO43186 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRXO43186 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRXO43186 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRXO43186 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRXO43186 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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