Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLXNB1O43157 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms