Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1CO15160 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms