Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
APAF1O14727 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
APAF1O14727 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
APAF1O14727 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
APAF1O14727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
APAF1O14727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
APAF1O14727 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
APAF1O14727 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
APAF1O14727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
APAF1O14727 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APAF1O14727 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APAF1O14727 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APAF1O14727 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
APAF1O14727 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms